La reforma de l'Enquesta industrial d'empreses, aplicada a partir dels resultats de l'any 2008, ha estat conseqüència de l'adaptació al nou Reglament europeu d'estadístiques estructurals a les empreses (SBS), a la nova Classificació nacional d'activitats econòmiques (CNAE-2009) i al nou Pla general de comptabilitat, aprovat l'any 2007. També s'han introduït algunes modificacions per millorar la qualitat de l'enquesta mantenint l'objectiu estratègic de reduir la càrrega de resposta dels informants.
Els canvis que la reforma ha comportat han provocat un trencament metodològic de la sèrie, que impedeix la comparació interanual de la majoria de sectors i de bona part de les variables. Els resultats de la sèrie històrica iniciada l'any 1993 es poden consultar a Enquesta industrial d'empreses (CCAE-93).
Per altra banda, també està disponible en format PDF l'Estadística, producció i comptes de la indústria del període 2000 a 2007, que conté una àmplia informació de la indústria catalana basada en l'Enquesta industrial d'empreses i l'Enquesta industrial de productes. Aquesta publicació no s'elabora en l'actualitat. Els resultats de l'estadística de productes a partir de l'any 2008 es poden consultar a la nova base de dades de l'Enquesta industrial de productes.